优势特色鲜明,科研成果丰硕。学校在广西常见病、多发病的防治研究方面具有一定特色优势,在地中海贫血防治、区域高发肿瘤防治、血红蛋白研究、蛇毒研究、心血管疾病防治、药物创制研究、器官移植、断指再植、外周血造血干细胞移植等研究领域达到国际国内领先水平。学校现有国家级国际联合研究中心1个、国家基因检测示范中心1个、高等学校学科创新引智基地(“111计划”)1个、国家地方联合工程研究中心1个、省部共建协同创新中心1个(再生医学与医用生物资源开发应用协同创新中心)、国家卫生健康委委省共建重点实验室1个(国家卫生健康委地中海贫血防治重点实验室)、教育部重点实验室2个、教育部国际合作联合实验室1个、国家高等级病原微生物三级(BSL-3)实验室1个、病原微生物二级(BSL-2)实验室5个、国家中医药科研三级实验室3个、教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队1个、科技部创新人才推进计划重点领域创新团队1个、广西重点实验室12个、广西高校重点实验室11个、中国(广西)-东盟新发传染病联合实验室1个,广西卫生健康委员会重点实验室14个(含3个培育)、广西“2011”协同创新中心3个、广西工程技术研究中心3个、广西工程研究中心7个、广西临床医学研究中心14个、广西教育厅校地校企共建科技创新平台3个、广西马克思主义理论研究和建设工程基地1个、广西高校人文社会科学重点研究基地1个、广西自然科学基金创新研究团队8个、广西人才小高地5个、广西高校人才小高地创新团队(含广西高校高水平创新团队及卓越学者计划)20个、广西特色新型智库25个和广西生物样本库1个。学校先后获国家科技进步奖、教育部科技奖、广西科技进步奖、广西自然科学奖416项及广西社会科学优秀成果奖5项,其中,“十三五”以来新增省部级科技类奖项65项,包括教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖1项、广西科学技术特别贡献类特等奖2项、广西科学技术进步奖一等奖7项、广西自然科学奖一等奖1项、二等奖8项、广西社会科学优秀成果二等奖5项、广西创新争先奖6项、广西青年科技奖4项。“十三五”以来,发表英文高水平论文3372篇,并以第一作者或通讯作者身份在New England Journal of Medicine、Nature等国际顶级期刊发表原创性研究。学校向国内外公开出版发行《广西医科大学学报》《中国癌症防治杂志》和《结直肠肛门病外科杂志》3种学术期刊。